По внешнему виду и повадкам - это типичная гаичка. От других живущих с ней рядом синиц отличается крупной величиной и меньшей подвижностью, даже как будто неуклюжестью. Чаще всего ее можно наблюдать в средней и нижней частях кроны елки, причем не на концах ветвей, а ближе к стволу - там, где есть толстые боковые ветви, которые она часто долбит. Нередко спускается на землю. Там разыскивает корм на камнях и во мху, а ранней осенью и весной кормится преимущественно здесь, расклевывая полупустые еловые шишки и отдельные летучки семян. Как и другие синицы, насекомоядна, но с сентября по март (в урожайные годы) питается в основном семенами ели. Джунгарскую гаичку нельзя назвать молчаливой - разнообразные звуки, в том числе и наиболее характерное чуть гнусавое "жижижи" издает она довольно часто. Однако поет редко. Песня - многократное повторение одного и того же чистого и звонкого слога, нечто вроде "тиу-тиу-тиу-тиу" с ударением на "и", звучащее неторопливо и равномерно. Она напоминает песню пухляка, но гораздо звонче и сочнее.

В конце мая - начале июня в гнездах, устроенных в выдолбленных обеими птицами дуплах, появляется 4-6 белых с красновато-коричневыми крапинками яиц. Самка насиживает их 13-14 дней, птенцы остаются в гнезде неполных 22 дня. Самец и самка носят им насекомых, чаще гусениц и взрослых бабочек совок, комаров-долгоножек и какие-то мелкие галлы, которых собирают между еловых хвоинок. Внутри этих галлов, являющихся не чем иным как разросшейся тканью растения, находятся личинки вредных насекомых - получается оригинальный "бутерброд" из растительного и животного корма. В первые полмесяца родители кормят птенцов от 150 до 220 раз в день, а в последнюю неделю их пребывания в гнезде - около 400 раз в день. Вылетевших птенцов самец и самка подкармливают и опекают еще не меньше трех недель.